A Magyar Helsinki Bizottság munkájának főbb jelenlegi és volt támogatói:
ENSZ Menekültügyi Főbiztossága (UNHCR)
Nyílt Társadalom Intézet, Budapest (Open Society Institute)
Európai Bizottság
Európai Menekültügyi Alap
Európai Visszatérési Alap
The Trust for Civil Society in Central and Eastern Europe
Open Society Justice Initiative
Nemzeti Civil Alapprogram
Holland Királyság Külügyminisztériuma MATRA program
Soros Alapítvány
